Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1-1P60608 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERVFC1-1P60608 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVFC1-1P60608 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 821.7 ms