Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN15P56746 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN15P56746 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN15P56746 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms