Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHB1P54762 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB1P54762 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB1P54762 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB1P54762 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms