Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9A3P48764 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC9A3P48764 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC9A3P48764 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC9A3P48764 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms