Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RABIFP47224 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABIFP47224 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABIFP47224 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABIFP47224 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABIFP47224 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABIFP47224 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RABIFP47224 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RABIFP47224 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABIFP47224 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABIFP47224 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABIFP47224 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABIFP47224 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABIFP47224 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RABIFP47224 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABIFP47224 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABIFP47224 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABIFP47224 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RABIFP47224 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RABIFP47224 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABIFP47224 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABIFP47224 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABIFP47224 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABIFP47224 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABIFP47224 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RABIFP47224 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RABIFP47224 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABIFP47224 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABIFP47224 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABIFP47224 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABIFP47224 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RABIFP47224 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RABIFP47224 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABIFP47224 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RABIFP47224 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RABIFP47224 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABIFP47224 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABIFP47224 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABIFP47224 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABIFP47224 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABIFP47224 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RABIFP47224 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RABIFP47224 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RABIFP47224 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABIFP47224 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABIFP47224 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RABIFP47224 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RABIFP47224 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RABIFP47224 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RABIFP47224 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABIFP47224 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABIFP47224 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RABIFP47224 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABIFP47224 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABIFP47224 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABIFP47224 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RABIFP47224 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RABIFP47224 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms