Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA4P43681 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHRNA4P43681 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRNA4P43681 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRNA4P43681 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms