Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ECI1P42126 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ECI1P42126 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECI1P42126 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECI1P42126 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ECI1P42126 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ECI1P42126 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECI1P42126 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECI1P42126 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECI1P42126 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECI1P42126 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ECI1P42126 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ECI1P42126 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECI1P42126 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECI1P42126 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECI1P42126 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECI1P42126 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECI1P42126 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECI1P42126 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ECI1P42126 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECI1P42126 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ECI1P42126 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECI1P42126 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECI1P42126 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECI1P42126 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ECI1P42126 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ECI1P42126 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms