Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKCIP41743 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKCIP41743 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKCIP41743 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms