Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GARSP41250 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GARSP41250 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GARSP41250 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GARSP41250 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GARSP41250 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GARSP41250 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GARSP41250 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GARSP41250 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GARSP41250 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GARSP41250 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GARSP41250 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GARSP41250 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GARSP41250 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARSP41250 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARSP41250 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARSP41250 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARSP41250 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARSP41250 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GARSP41250 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARSP41250 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARSP41250 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARSP41250 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARSP41250 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GARSP41250 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GARSP41250 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GARSP41250 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GARSP41250 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GARSP41250 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GARSP41250 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GARSP41250 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GARSP41250 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GARSP41250 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
GARSP41250 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GARSP41250 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GARSP41250 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GARSP41250 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GARSP41250 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GARSP41250 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GARSP41250 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GARSP41250 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GARSP41250 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GARSP41250 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GARSP41250 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GARSP41250 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GARSP41250 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARSP41250 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GARSP41250 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARSP41250 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GARSP41250 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GARSP41250 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GARSP41250 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GARSP41250 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GARSP41250 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GARSP41250 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms