Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GRIK1P39086 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GRIK1P39086 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GRIK1P39086 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIK1P39086 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms