Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ITGAEP38570 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
ITGAEP38570 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
ITGAEP38570 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
ITGAEP38570 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
ITGAEP38570 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms