Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJC1P36383 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJC1P36383 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJC1P36383 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJC1P36383 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GJC1P36383 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJC1P36383 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJC1P36383 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJC1P36383 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJC1P36383 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJC1P36383 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJC1P36383 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJC1P36383 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJC1P36383 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJC1P36383 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJC1P36383 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJC1P36383 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJC1P36383 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJC1P36383 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJC1P36383 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJC1P36383 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJC1P36383 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJC1P36383 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJC1P36383 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJC1P36383 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJC1P36383 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJC1P36383 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJC1P36383 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJC1P36383 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJC1P36383 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJC1P36383 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJC1P36383 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJC1P36383 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJC1P36383 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJC1P36383 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJC1P36383 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJC1P36383 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJC1P36383 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJC1P36383 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJC1P36383 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJC1P36383 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJC1P36383 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJC1P36383 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJC1P36383 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJC1P36383 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJC1P36383 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJC1P36383 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJC1P36383 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJC1P36383 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJC1P36383 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJC1P36383 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJC1P36383 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms