Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCKBRP32239 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCKBRP32239 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCKBRP32239 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms