Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD1CP29017 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD1CP29017 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD1CP29017 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD1CP29017 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD1CP29017 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD1CP29017 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD1CP29017 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD1CP29017 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD1CP29017 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD1CP29017 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD1CP29017 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD1CP29017 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD1CP29017 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD1CP29017 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD1CP29017 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD1CP29017 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD1CP29017 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD1CP29017 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD1CP29017 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD1CP29017 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD1CP29017 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CD1CP29017 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD1CP29017 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD1CP29017 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD1CP29017 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD1CP29017 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD1CP29017 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD1CP29017 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD1CP29017 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD1CP29017 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD1CP29017 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD1CP29017 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD1CP29017 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD1CP29017 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD1CP29017 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD1CP29017 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD1CP29017 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD1CP29017 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD1CP29017 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD1CP29017 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CD1CP29017 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD1CP29017 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD1CP29017 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD1CP29017 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD1CP29017 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD1CP29017 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD1CP29017 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD1CP29017 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CD1CP29017 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD1CP29017 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD1CP29017 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD1CP29017 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD1CP29017 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD1CP29017 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD1CP29017 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD1CP29017 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD1CP29017 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD1CP29017 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD1CP29017 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms