Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALRP27797 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALRP27797 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALRP27797 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALRP27797 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALRP27797 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALRP27797 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALRP27797 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALRP27797 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALRP27797 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALRP27797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALRP27797 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALRP27797 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALRP27797 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALRP27797 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALRP27797 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALRP27797 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALRP27797 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALRP27797 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALRP27797 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALRP27797 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALRP27797 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALRP27797 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALRP27797 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALRP27797 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALRP27797 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALRP27797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALRP27797 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALRP27797 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALRP27797 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALRP27797 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALRP27797 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALRP27797 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALRP27797 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALRP27797 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CALRP27797 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALRP27797 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALRP27797 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALRP27797 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALRP27797 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CALRP27797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALRP27797 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALRP27797 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALRP27797 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALRP27797 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CALRP27797 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALRP27797 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALRP27797 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALRP27797 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALRP27797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALRP27797 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CALRP27797 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CALRP27797 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms