Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GADD45AP24522 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GADD45AP24522 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GADD45AP24522 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GADD45AP24522 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms