Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TGM1P22735 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM1P22735 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM1P22735 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TGM1P22735 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM1P22735 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM1P22735 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM1P22735 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TGM1P22735 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM1P22735 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM1P22735 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM1P22735 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM1P22735 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TGM1P22735 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM1P22735 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM1P22735 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM1P22735 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TGM1P22735 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TGM1P22735 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM1P22735 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM1P22735 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM1P22735 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM1P22735 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM1P22735 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TGM1P22735 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM1P22735 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM1P22735 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM1P22735 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM1P22735 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM1P22735 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TGM1P22735 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TGM1P22735 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TGM1P22735 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM1P22735 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM1P22735 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TGM1P22735 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TGM1P22735 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM1P22735 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM1P22735 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM1P22735 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TGM1P22735 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGM1P22735 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TGM1P22735 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TGM1P22735 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TGM1P22735 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM1P22735 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM1P22735 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM1P22735 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM1P22735 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM1P22735 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TGM1P22735 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms