Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCP1P17987 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCP1P17987 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP1P17987 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP1P17987 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP1P17987 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP1P17987 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCP1P17987 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP1P17987 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP1P17987 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCP1P17987 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP1P17987 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP1P17987 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP1P17987 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCP1P17987 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCP1P17987 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCP1P17987 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCP1P17987 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCP1P17987 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP1P17987 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP1P17987 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP1P17987 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCP1P17987 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCP1P17987 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCP1P17987 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCP1P17987 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCP1P17987 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCP1P17987 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCP1P17987 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCP1P17987 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCP1P17987 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCP1P17987 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCP1P17987 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCP1P17987 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TCP1P17987 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCP1P17987 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCP1P17987 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCP1P17987 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCP1P17987 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCP1P17987 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCP1P17987 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCP1P17987 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCP1P17987 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCP1P17987 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCP1P17987 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCP1P17987 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TCP1P17987 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCP1P17987 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCP1P17987 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCP1P17987 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCP1P17987 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms