Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTHFD2P13995 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTHFD2P13995 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTHFD2P13995 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms