Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
GLI2P10070 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
GLI2P10070 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GLI2P10070 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GLI2P10070 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GLI2P10070 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
GLI2P10070 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
GLI2P10070 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GLI2P10070 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
GLI2P10070 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
GLI2P10070 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
GLI2P10070 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
GLI2P10070 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
GLI2P10070 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI2P10070 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI2P10070 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI2P10070 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI2P10070 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI2P10070 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
GLI2P10070 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GLI2P10070 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
GLI2P10070 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GLI2P10070 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GLI2P10070 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
GLI2P10070 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
GLI2P10070 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
GLI2P10070 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
GLI2P10070 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
GLI2P10070 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
GLI2P10070 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
GLI2P10070 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
GLI2P10070 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
GLI2P10070 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
GLI2P10070 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
GLI2P10070 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
GLI2P10070 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
GLI2P10070 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GLI2P10070 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
GLI2P10070 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
GLI2P10070 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GLI2P10070 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
GLI2P10070 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
GLI2P10070 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
GLI2P10070 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
GLI2P10070 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
GLI2P10070 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GLI2P10070 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GLI2P10070 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
GLI2P10070 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
GLI2P10070 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
GLI2P10070 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GLI2P10070 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GLI2P10070 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GLI2P10070 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
GLI2P10070 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GLI2P10070 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GLI2P10070 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GLI2P10070 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
GLI2P10070 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GLI2P10070 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
GLI2P10070 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
GLI2P10070 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
GLI2P10070 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GLI2P10070 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
GLI2P10070 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GLI2P10070 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GLI2P10070 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
GLI2P10070 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
GLI2P10070 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GLI2P10070 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
GLI2P10070 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
GLI2P10070 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GLI2P10070 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GLI2P10070 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GLI2P10070 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GLI2P10070 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GLI2P10070 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GLI2P10070 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GLI2P10070 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
GLI2P10070 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
GLI2P10070 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GLI2P10070 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GLI2P10070 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GLI2P10070 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GLI2P10070 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GLI2P10070 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GLI2P10070 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI2P10070 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI2P10070 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI2P10070 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GLI2P10070 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms