Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SETSIPP0DME0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SETSIPP0DME0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SETSIPP0DME0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SETSIPP0DME0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms