Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC00271P0C7V0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC00271P0C7V0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LINC00271P0C7V0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LINC00271P0C7V0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms