Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GJB1P08034 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB1P08034 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB1P08034 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB1P08034 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB1P08034 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB1P08034 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB1P08034 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB1P08034 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB1P08034 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB1P08034 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB1P08034 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GJB1P08034 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB1P08034 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB1P08034 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJB1P08034 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GJB1P08034 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB1P08034 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB1P08034 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB1P08034 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB1P08034 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB1P08034 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB1P08034 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB1P08034 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB1P08034 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB1P08034 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB1P08034 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB1P08034 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB1P08034 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB1P08034 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB1P08034 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB1P08034 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB1P08034 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB1P08034 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB1P08034 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB1P08034 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB1P08034 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB1P08034 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB1P08034 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB1P08034 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB1P08034 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB1P08034 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB1P08034 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB1P08034 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB1P08034 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB1P08034 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB1P08034 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB1P08034 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB1P08034 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB1P08034 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB1P08034 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB1P08034 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB1P08034 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB1P08034 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJB1P08034 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJB1P08034 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB1P08034 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB1P08034 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB1P08034 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GJB1P08034 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB1P08034 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms