Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HLA-DOAP06340 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HLA-DOAP06340 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HLA-DOAP06340 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HLA-DOAP06340 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms