Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGN2P05204 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGN2P05204 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms