Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRNPP04156 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRNPP04156 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRNPP04156 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRNPP04156 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRNPP04156 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRNPP04156 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRNPP04156 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRNPP04156 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRNPP04156 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRNPP04156 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRNPP04156 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRNPP04156 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRNPP04156 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRNPP04156 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRNPP04156 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRNPP04156 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRNPP04156 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRNPP04156 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRNPP04156 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRNPP04156 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRNPP04156 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRNPP04156 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRNPP04156 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRNPP04156 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRNPP04156 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRNPP04156 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRNPP04156 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRNPP04156 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRNPP04156 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRNPP04156 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRNPP04156 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRNPP04156 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRNPP04156 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRNPP04156 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRNPP04156 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRNPP04156 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRNPP04156 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRNPP04156 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRNPP04156 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRNPP04156 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRNPP04156 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRNPP04156 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRNPP04156 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRNPP04156 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRNPP04156 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRNPP04156 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRNPP04156 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRNPP04156 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRNPP04156 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRNPP04156 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms