Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNNC2P02585 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC2P02585 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC2P02585 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC2P02585 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms