Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C6orf47O95873 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C6orf47O95873 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf47O95873 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf47O95873 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms