Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TSPAN13O95857 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TSPAN13O95857 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TSPAN13O95857 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms