Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCNTO95613 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PCNTO95613 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNTO95613 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNTO95613 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNTO95613 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCNTO95613 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNTO95613 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNTO95613 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNTO95613 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNTO95613 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PCNTO95613 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCNTO95613 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PCNTO95613 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PCNTO95613 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCNTO95613 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCNTO95613 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PCNTO95613 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNTO95613 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNTO95613 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNTO95613 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PCNTO95613 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PCNTO95613 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PCNTO95613 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PCNTO95613 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PCNTO95613 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCNTO95613 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCNTO95613 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCNTO95613 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PCNTO95613 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCNTO95613 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PCNTO95613 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNTO95613 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNTO95613 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PCNTO95613 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNTO95613 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNTO95613 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PCNTO95613 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNTO95613 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNTO95613 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNTO95613 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNTO95613 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCNTO95613 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNTO95613 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNTO95613 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNTO95613 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNTO95613 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCNTO95613 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNTO95613 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNTO95613 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNTO95613 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNTO95613 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNTO95613 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PCNTO95613 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCNTO95613 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PCNTO95613 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNTO95613 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNTO95613 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNTO95613 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PCNTO95613 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCNTO95613 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCNTO95613 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCNTO95613 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCNTO95613 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PCNTO95613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNTO95613 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNTO95613 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNTO95613 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNTO95613 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNTO95613 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCNTO95613 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCNTO95613 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNTO95613 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNTO95613 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNTO95613 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms