Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPTXRO95502 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPTXRO95502 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NPTXRO95502 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NPTXRO95502 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms