Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC2O95347 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC2O95347 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC2O95347 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC2O95347 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC2O95347 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC2O95347 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC2O95347 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC2O95347 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC2O95347 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC2O95347 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC2O95347 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC2O95347 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC2O95347 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC2O95347 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC2O95347 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC2O95347 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC2O95347 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC2O95347 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC2O95347 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC2O95347 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC2O95347 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC2O95347 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC2O95347 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMC2O95347 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC2O95347 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC2O95347 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC2O95347 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC2O95347 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMC2O95347 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC2O95347 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC2O95347 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC2O95347 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC2O95347 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC2O95347 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMC2O95347 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC2O95347 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC2O95347 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC2O95347 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC2O95347 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC2O95347 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC2O95347 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC2O95347 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC2O95347 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC2O95347 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC2O95347 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC2O95347 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC2O95347 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC2O95347 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC2O95347 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC2O95347 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC2O95347 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC2O95347 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC2O95347 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC2O95347 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC2O95347 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC2O95347 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC2O95347 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC2O95347 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC2O95347 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC2O95347 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC2O95347 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC2O95347 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC2O95347 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC2O95347 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC2O95347 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC2O95347 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC2O95347 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC2O95347 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC2O95347 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC2O95347 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC2O95347 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC2O95347 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC2O95347 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC2O95347 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMC2O95347 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMC2O95347 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC2O95347 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC2O95347 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC2O95347 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC2O95347 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms