Protein–RNA interactions for Protein: O75888

TNFSF13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13O75888 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF13O75888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF13O75888 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF13O75888 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF13O75888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF13O75888 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF13O75888 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF13O75888 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms