Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH16O75309 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH16O75309 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH16O75309 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH16O75309 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH16O75309 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH16O75309 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH16O75309 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH16O75309 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH16O75309 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDH16O75309 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH16O75309 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH16O75309 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH16O75309 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH16O75309 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH16O75309 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH16O75309 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH16O75309 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH16O75309 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH16O75309 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH16O75309 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH16O75309 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH16O75309 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH16O75309 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH16O75309 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH16O75309 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH16O75309 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH16O75309 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH16O75309 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH16O75309 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH16O75309 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH16O75309 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH16O75309 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH16O75309 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH16O75309 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH16O75309 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH16O75309 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH16O75309 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH16O75309 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH16O75309 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH16O75309 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDH16O75309 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDH16O75309 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH16O75309 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH16O75309 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH16O75309 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH16O75309 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH16O75309 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms