Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTNSO60931 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTNSO60931 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNSO60931 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNSO60931 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNSO60931 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNSO60931 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNSO60931 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNSO60931 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNSO60931 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNSO60931 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNSO60931 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNSO60931 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNSO60931 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNSO60931 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNSO60931 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNSO60931 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNSO60931 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNSO60931 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNSO60931 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNSO60931 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNSO60931 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNSO60931 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNSO60931 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNSO60931 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNSO60931 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNSO60931 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNSO60931 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNSO60931 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNSO60931 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNSO60931 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNSO60931 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNSO60931 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNSO60931 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNSO60931 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNSO60931 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTNSO60931 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTNSO60931 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTNSO60931 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms