Protein–RNA interactions for Protein: O60763

USO1, General vesicular transport factor p115, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USO1O60763 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USO1O60763 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USO1O60763 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USO1O60763 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USO1O60763 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USO1O60763 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USO1O60763 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USO1O60763 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USO1O60763 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USO1O60763 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USO1O60763 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USO1O60763 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USO1O60763 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USO1O60763 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USO1O60763 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USO1O60763 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USO1O60763 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USO1O60763 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USO1O60763 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USO1O60763 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USO1O60763 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USO1O60763 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USO1O60763 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USO1O60763 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USO1O60763 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USO1O60763 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USO1O60763 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USO1O60763 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
USO1O60763 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USO1O60763 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USO1O60763 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USO1O60763 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USO1O60763 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USO1O60763 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USO1O60763 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USO1O60763 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USO1O60763 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USO1O60763 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USO1O60763 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USO1O60763 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USO1O60763 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USO1O60763 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USO1O60763 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USO1O60763 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USO1O60763 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USO1O60763 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USO1O60763 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USO1O60763 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USO1O60763 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USO1O60763 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USO1O60763 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USO1O60763 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USO1O60763 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USO1O60763 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USO1O60763 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USO1O60763 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USO1O60763 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USO1O60763 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms