Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SORBS3O60504 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SORBS3O60504 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SORBS3O60504 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms