Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KDM1AO60341 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KDM1AO60341 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM1AO60341 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms