Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUX1O43812 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUX1O43812 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUX1O43812 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUX1O43812 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUX1O43812 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUX1O43812 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUX1O43812 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX1O43812 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX1O43812 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX1O43812 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX1O43812 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX1O43812 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DUX1O43812 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUX1O43812 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUX1O43812 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DUX1O43812 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DUX1O43812 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DUX1O43812 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DUX1O43812 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX1O43812 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX1O43812 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX1O43812 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX1O43812 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DUX1O43812 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX1O43812 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX1O43812 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX1O43812 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX1O43812 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX1O43812 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DUX1O43812 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DUX1O43812 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUX1O43812 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DUX1O43812 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUX1O43812 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DUX1O43812 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX1O43812 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX1O43812 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX1O43812 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX1O43812 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DUX1O43812 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX1O43812 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX1O43812 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX1O43812 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUX1O43812 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX1O43812 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX1O43812 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX1O43812 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUX1O43812 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUX1O43812 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUX1O43812 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUX1O43812 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUX1O43812 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms