Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTRA2O43464 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HTRA2O43464 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HTRA2O43464 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms