Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRTM2O43300 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRTM2O43300 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRRTM2O43300 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRTM2O43300 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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