Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
POLR2DO15514 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR2DO15514 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR2DO15514 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR2DO15514 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms