Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
IFIT3O14879 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
IFIT3O14879 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIT3O14879 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIT3O14879 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms