Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAPN9O14815 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPN9O14815 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms