Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TRAPPC2LH3BP13 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC2LH3BP13 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2LH3BP13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2LH3BP13 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms