Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM220BPB1ANY3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM220BPB1ANY3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM220BPB1ANY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms