Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKUB1A6NFN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKUB1A6NFN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ANKUB1A6NFN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms