Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LINC01553A4QN01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LINC01553A4QN01 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LINC01553A4QN01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LINC01553A4QN01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms