Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TCRBV5S2A0A599 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCRBV5S2A0A599 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBV5S2A0A599 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms