Protein–RNA interactions for Protein: R4GMX3

COMMD3-BMI1, COMMD3-BMI1 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3-BMI1R4GMX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COMMD3-BMI1R4GMX3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COMMD3-BMI1R4GMX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COMMD3-BMI1R4GMX3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms